home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00791 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.8 KB  |  57 lines
  1. ********************************************
  2. * Heat shock hsp20 proteins family profile *
  3. ********************************************
  4.  
  5. Prokaryotic   and  eukaryotic  organisms   respond  to  heat  shock  or  other
  6. environmental  stress  by  the  induction   of   the  synthesis   of  proteins
  7. collectively known as heat-shock proteins (hsp) [1].  Amongst them is a family
  8. of proteins  with  an  average   molecular weight of 20 Kd, known as the hsp20
  9. proteins [2,3,4] and which  seem  to  act as chaperones that can protect other
  10. proteins against heat-induced denaturation and aggregation. The hsp20 proteins
  11. seem to  to  form  large  heterooligomeric  aggregates.  The  hsp20  family is
  12. currently composed of the following members:
  13.  
  14.  - Vertebrate heat shock protein hsp27 (hsp25), which are induced by a variety
  15.    of environmental stresses.
  16.  - Drosophila heat shock proteins hsp22, hsp23, hsp26, hsp27, hsp67BA and BC.
  17.  - Caenorhabditis elegans hsp16 multigene family.
  18.  - Fungal HSP26 (budding yeast) and hsp30 (Neurospora crassa).
  19.  - Plant small hsps.  Plants have four classes of hsp20:  class I and II which
  20.    are cytoplasmic;  class III which is in the chloroplast  and class IV which
  21.    is in the endomembrane.
  22.  - Alpha-crystallin   A   and   B  chains.  Alpha-crystallin  is  an  abundant
  23.    constituent of the eye lens of most vertebrate species.  Its  main function
  24.    appears to be the maintenance  of the correct refractive index of the lens.
  25.    It is also found in other tissues where it seems to act as a chaperone.
  26.  - Schistosoma mansoni major egg antigen p40. Structurally p40 is built of two
  27.    tandem hsp20 domains.
  28.  - A  variety  of  prokaryotic proteins: ibpA and ibpB from  Escherichia coli;
  29.    hsp18 from  Clostridium  acetobutylicum;  spore  protein  SP21  (hspA) from
  30.    Stigmatella aurantiaca;  Mycobacterium leprae 18 Kd antigen;  Mycobacterium
  31.    tuberculosis 14 Kd antigen.
  32.  
  33. Structurally, this family is characterized  by  the presence of a conserved C-
  34. terminal domain of about 100 residues. The profile developed to detect members
  35. of the hsp20 family is based on an alignment of this domain.
  36.  
  37. -Sequences known to belong to this class detected by the profile: ALL.
  38. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  39.  
  40. -Note: this is the first profile entry to be integrated into PROSITE !
  41.  
  42. -Expert(s) to contact by email: Leunissen J.A.M.
  43.                                 jackl@caos.kun.nl
  44.                                 de Jong W.W.
  45.                                 u629000@hnykun11.bitnet
  46.  
  47. -Last update: June 1994 / First entry.
  48.  
  49. [ 1] Lindquist S., Craig E.A.
  50.      Annu. Rev. Genet. 22:631-677(1988).
  51. [ 2] de Jong W.W., Leunissen J.A.M., Voorter C.E.M.
  52.      Mol. Biol. Evol. 10:103-126(1993).
  53. [ 3] Jaenicke R., Creighton T.E.
  54.      Curr. Biol. 3:234-235(1993).
  55. [ 4] Jakob U., Buchner J.
  56.      Trends Biochem. Sci. 19:205-211(1994).
  57.